94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1564 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1564  ankyrin  100 
 
 		 577 aa  1164    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.991027  normal  0.0684375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4904  Ankyrin  34.5 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0068  ankyrin  26.58 
 
 		 534 aa  103  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5367  hypothetical protein  29.32 
 
 		 555 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0331655  normal  0.148887 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3447  hypothetical protein  28.88 
 
 		 555 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319087  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4920  hypothetical protein  28.88 
 
 		 555 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.186721  normal  0.0651204 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0772  hypothetical protein  29.89 
 
 		 555 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840859  normal  0.0209356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5149  ankyrin  26.91 
 
 		 589 aa  93.6  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377523  normal  0.510979 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  27.59 
 
 		 870 aa  82.4  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3874  ankyrin repeat-containing protein  24.44 
 
 		 511 aa  75.5  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.50205 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1585 aa  71.2  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2701  Ankyrin  26.43 
 
 		 385 aa  66.2  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.575669  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  27.76 
 
 		 855 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30 
 
 		 1402 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  25.96 
 
 		 891 aa  63.9  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0291  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  26.46 
 
 		 224 aa  62.8  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.461089  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  24.43 
 
 		 1021 aa  60.8  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  22.92 
 
 		 490 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  26.5 
 
 		 821 aa  60.8  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0574  hypothetical protein  28.95 
 
 		 335 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  25.99 
 
 		 762 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  25.91 
 
 		 865 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  28.65 
 
 		 931 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  27.85 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1634  ankyrin repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1116 aa  57.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0269822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  32.24 
 
 		 157 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  25.63 
 
 		 494 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  25.16 
 
 		 756 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08304  conserved hypothetical protein  30.88 
 
 		 1198 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000526329 
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  26.79 
 
 		 474 aa  54.7  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  25.17 
 
 		 382 aa  54.7  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  29.05 
 
 		 469 aa  54.3  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  26.4 
 
 		 347 aa  53.9  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  23.31 
 
 		 404 aa  53.9  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  22.92 
 
 		 1030 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2372  ankyrin  25.22 
 
 		 519 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  28.01 
 
 		 1061 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  26 
 
 		 1005 aa  53.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2700  hypothetical protein  24.39 
 
 		 360 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.57882  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  51.6  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  28.35 
 
 		 1156 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  29.44 
 
 		 723 aa  52  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  25.34 
 
 		 2413 aa  51.6  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0301  Ankyrin  24.73 
 
 		 369 aa  51.2  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00164342  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1249 aa  51.2  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0996  hypothetical protein  23.38 
 
 		 447 aa  51.2  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0836466 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5133  predicted protein  29.95 
 
 		 184 aa  50.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  24.58 
 
 		 4520 aa  51.2  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  26.67 
 
 		 395 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  29.69 
 
 		 287 aa  50.8  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  26.62 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  23.68 
 
 		 731 aa  49.7  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1813  ankyrin repeat-containing protein  26.09 
 
 		 815 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000177587  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  29.14 
 
 		 161 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10397  conserved hypothetical protein  29.27 
 
 		 307 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  25.5 
 
 		 305 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1807  Ankyrin  35.63 
 
 		 136 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1667  Ankyrin  26.88 
 
 		 509 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  27.67 
 
 		 163 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2699  Ankyrin  26 
 
 		 360 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6935  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  26.11 
 
 		 345 aa  49.7  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  28.5 
 
 		 220 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  23.33 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  21.27 
 
 		 640 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  20.72 
 
 		 715 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  27.01 
 
 		 1133 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  23.05 
 
 		 542 aa  48.1  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1804  Ankyrin  24.52 
 
 		 229 aa  47.8  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000687  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43280  predicted protein  27.27 
 
 		 211 aa  47.8  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.390261  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001115  hypothetical protein  29.2 
 
 		 425 aa  47.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.401895  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  27.56 
 
 		 203 aa  47.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0883  Ankyrin  34.38 
 
 		 494 aa  47.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  27.27 
 
 		 173 aa  46.6  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0498  ankyrin repeat-containing protein  25 
 
 		 335 aa  46.6  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  29.28 
 
 		 479 aa  47  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05168  NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07030)  24.02 
 
 		 1307 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.6235  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04190  palmitoyltransferase, putative  27.78 
 
 		 776 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3066  Ankyrin  26.84 
 
 		 214 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.590896  hitchhiker  0.00125449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  31.25 
 
 		 185 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0631  ankyrin repeat-containing protein  26.29 
 
 		 504 aa  45.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000258922  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  27.12 
 
 		 541 aa  45.4  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  23.65 
 
 		 426 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  29.32 
 
 		 222 aa  44.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  26.71 
 
 		 197 aa  45.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1824  ankyrin  24.7 
 
 		 226 aa  45.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109877  hitchhiker  0.0044061 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  25.25 
 
 		 750 aa  44.7  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1317  hypothetical protein  27.89 
 
 		 536 aa  44.7  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08300  conserved hypothetical protein  24.36 
 
 		 1977 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000214418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2488  Ankyrin  33.33 
 
 		 196 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  23.51 
 
 		 483 aa  44.3  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  23.68 
 
 		 544 aa  43.9  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06671  hypothetical protein  35.82 
 
 		 423 aa  43.9  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2080  Ankyrin  25.41 
 
 		 668 aa  43.5  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000184702  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  28.29 
 
 		 162 aa  43.5  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>