41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4904 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4904  Ankyrin  100 
 
 
476 aa  922    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1564  ankyrin  35.33 
 
 
577 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.991027  normal  0.0684375 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0068  ankyrin  32.88 
 
 
534 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5149  ankyrin  28.76 
 
 
589 aa  83.2  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377523  normal  0.510979 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0772  hypothetical protein  28.4 
 
 
555 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840859  normal  0.0209356 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5367  hypothetical protein  29.29 
 
 
555 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0331655  normal  0.148887 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4920  hypothetical protein  28.89 
 
 
555 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.186721  normal  0.0651204 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3447  hypothetical protein  28.89 
 
 
555 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319087  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3874  ankyrin repeat-containing protein  30 
 
 
511 aa  62.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.50205 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0301  Ankyrin  23.42 
 
 
369 aa  61.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00164342  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2372  ankyrin  38.2 
 
 
519 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  30 
 
 
1021 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  28.87 
 
 
1061 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  27.75 
 
 
2413 aa  52.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  27.13 
 
 
1402 aa  49.7  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08300  conserved hypothetical protein  26.56 
 
 
1977 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000214418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0382  ankyrin repeat protein  29.32 
 
 
201 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.415795 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  23.74 
 
 
731 aa  46.2  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0883  Ankyrin  37.89 
 
 
494 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0349  ankyrin repeat-containing protein  28.27 
 
 
201 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  26.4 
 
 
1249 aa  45.1  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2411  Ankyrin  27.72 
 
 
194 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.020704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0337  ankyrin repeat-containing protein  28.8 
 
 
201 aa  44.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3305  ankyrin  28.8 
 
 
201 aa  44.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  37.36 
 
 
296 aa  44.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00274  predicted transcriptional regulator with ankyrin domain  28.8 
 
 
201 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00277  hypothetical protein  28.8 
 
 
201 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.568599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3288  Ankyrin  28.8 
 
 
201 aa  44.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  28.37 
 
 
426 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1788  aankyrin repeat-containing protein  28.27 
 
 
291 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05824  Palmitoyltransferase akr1 (EC 2.3.1.-)(Ankyrin repeat-containing protein akr1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0V6]  41.38 
 
 
737 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  31.12 
 
 
1156 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0574  hypothetical protein  25.12 
 
 
335 aa  44.3  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  25.78 
 
 
762 aa  43.9  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  29.07 
 
 
855 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04190  palmitoyltransferase, putative  37.21 
 
 
776 aa  43.9  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  28.65 
 
 
490 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63660  hypothetical protein  49.12 
 
 
411 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0174567  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  33.33 
 
 
821 aa  43.5  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0379  ankyrin repeat-containing protein  28.27 
 
 
201 aa  43.5  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.89591  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  30.2 
 
 
395 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>