87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0696 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0696  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1457  hypothetical protein  68.37 
 
 		 233 aa  295  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1006  metal dependent phosphohydrolase  69.19 
 
 		 214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0465663  normal  0.366777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1158  metal dependent phosphohydrolase  68.25 
 
 		 214 aa  280  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2224  metal dependent phosphohydrolase  62.44 
 
 		 221 aa  275  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139154 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4767  metal dependent phosphohydrolase  64.45 
 
 		 214 aa  268  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126983  hitchhiker  0.00228546 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7497  metal-dependent phosphohydrolase  66.19 
 
 		 214 aa  267  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.32308 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3954  metal dependent phosphohydrolase  65.87 
 
 		 216 aa  259  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4131  metal dependent phosphohydrolase, HD region  62.2 
 
 		 222 aa  247  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3195  metal dependent phosphohydrolase  56.67 
 
 		 246 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7189  normal  0.125641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2524  HD domain-containing protein  56.67 
 
 		 218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00879841  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0996  HD domain protein  58.96 
 
 		 219 aa  235  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0861  metal-dependent phosphohydrolase  58.49 
 
 		 219 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.467679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5268  metal dependent phosphohydrolase  58.65 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.221886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1531  metal dependent phosphohydrolase  49.21 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000568  metal-dependent phosphohydrolase  41.8 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3492  metal dependent phosphohydrolase  46.63 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.866996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3615  metal dependent phosphohydrolase  47.12 
 
 		 236 aa  165  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2059  metal dependent phosphohydrolase, HD region  47.69 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2552  hypothetical protein  48.57 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.427776 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1513  putative metal dependent phosphohydrolase  43.23 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0702104  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05316  hypothetical protein  40.74 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0366  metal dependent phosphohydrolase  46 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.865468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1681  hypothetical protein  42.71 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2739  hypothetical protein  42.71 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.349969 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1687  metal dependent phosphohydrolase  43.23 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.138393  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1237  metal dependent phosphohydrolase  40.8 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.753462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2064  hypothetical protein  45.98 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0016347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2194  hypothetical protein  43.23 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000183278  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1223  hypothetical protein  43.23 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.239453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0922  hypothetical protein  42.71 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.679798  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2335  metal dependent phosphohydrolase  42.78 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1126  hypothetical protein  42.29 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010564  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2156  hypothetical protein  41.29 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.148177 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1248  hypothetical protein  41.79 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.820142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2152  hypothetical protein  41.79 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2209  hypothetical protein  41.29 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.796217  normal  0.438715 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0507  metal dependent phosphohydrolase  35.45 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0267  metal dependent phosphohydrolase  35.78 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1162  metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.031643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6614  metal dependent phosphohydrolase  33.66 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.0170307 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0221  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1501  metal dependent phosphohydrolase  34.2 
 
 		 198 aa  92  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2427  metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 		 192 aa  91.7  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2132  metal dependent phosphohydrolase  34.17 
 
 		 265 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1183  metal-dependent phosphohydrolase  33.17 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1508  metal dependent phosphohydrolase  34.39 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1612  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1102  metal-dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000240201  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0367  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 218 aa  85.1  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00363061  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0195  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  32.68 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.892271  normal  0.262297 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1760  HD domain-containing protein  29.13 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0857727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1644  metal dependent phosphohydrolase  31.41 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3253  hypothetical protein  43.38 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0967  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2224  HD domain-containing protein  30.05 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0142488  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2575  metal dependent phosphohydrolase  30.85 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0644957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2172  HD domain protein  30.24 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.763705  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3005  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  36.52 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.350219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2307  HD domain protein  29.56 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00857429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3146  HD domain protein  30.24 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000400766  normal  0.0545051 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1981  HD superfamily hydrolase  29.56 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00267422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1963  HD superfamily hydrolase  29.56 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2189  HD domain protein  29.56 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1999  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0908  HD domain-containing protein  30.81 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2163  HD domain-containing protein  29.06 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2009  HD domain-containing protein  29.06 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0187845  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1696  HD domain-containing protein  31.53 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1835  metal dependent phosphohydrolase  34.96 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.930216  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1094  metal-dependent phosphohydrolase  31.66 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3045  metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0180  HD superfamily hydrolase  25.46 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000181993 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03700  metal-dependent phosphohydrolase  29.74 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7743  predicted protein  31.25 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394853  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2126  hypothetical protein  31.63 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000279259  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2164  metal-dependent phosphohydrolase  31.63 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868351  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09449  HD superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03035)  30.81 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0299  HD superfamily hydrolase  27.67 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.329827  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0543  metal dependent phosphohydrolase  37.68 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0935  metal dependent phosphohydrolase  26.8 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.462816  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0901  metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2470  metal dependent phosphohydrolase  32.11 
 
 		 282 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  30.07 
 
 		 526 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3081  metal dependent phosphohydrolase  29.36 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.323647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0344  metal dependent phosphohydrolase  29.36 
 
 		 228 aa  42  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00440  conserved hypothetical protein  31.68 
 
 		 168 aa  42  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0533687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>