90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3005 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3005  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.350219  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0367  metal dependent phosphohydrolase  52.38 
 
 
218 aa  241  6e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00363061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1102  metal-dependent phosphohydrolase  53.08 
 
 
240 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000240201  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2575  metal dependent phosphohydrolase  53.81 
 
 
216 aa  221  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0644957  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2132  metal dependent phosphohydrolase  52.11 
 
 
265 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1094  metal-dependent phosphohydrolase  52.13 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1612  metal dependent phosphohydrolase  46.48 
 
 
215 aa  202  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0908  HD domain-containing protein  48.77 
 
 
203 aa  198  7e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03700  metal-dependent phosphohydrolase  42.65 
 
 
220 aa  194  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0967  metal dependent phosphohydrolase  43.72 
 
 
217 aa  193  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6614  metal dependent phosphohydrolase  46.89 
 
 
222 aa  190  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.0170307 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1963  HD superfamily hydrolase  45.07 
 
 
215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2172  HD domain protein  45.07 
 
 
215 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.763705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2189  HD domain protein  45.07 
 
 
215 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1981  HD superfamily hydrolase  45.07 
 
 
215 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00267422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3146  HD domain protein  45.07 
 
 
215 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000400766  normal  0.0545051 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2163  HD domain-containing protein  45.07 
 
 
215 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2009  HD domain-containing protein  45.07 
 
 
215 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0187845  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2307  HD domain protein  44.6 
 
 
215 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00857429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2224  HD domain-containing protein  45.07 
 
 
215 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0142488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1999  metal dependent phosphohydrolase  44.6 
 
 
215 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1760  HD domain-containing protein  41.2 
 
 
221 aa  180  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0857727  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0267  metal dependent phosphohydrolase  41.43 
 
 
214 aa  169  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7743  predicted protein  45.12 
 
 
222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394853  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0299  HD superfamily hydrolase  38.39 
 
 
217 aa  156  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.329827  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0195  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  44.93 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.892271  normal  0.262297 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1162  metal dependent phosphohydrolase  41 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.031643  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1696  HD domain-containing protein  37.91 
 
 
217 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1644  metal dependent phosphohydrolase  37.2 
 
 
210 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0221  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0935  metal dependent phosphohydrolase  38.42 
 
 
218 aa  126  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.462816  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0180  HD superfamily hydrolase  33.49 
 
 
217 aa  124  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000181993 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2164  metal-dependent phosphohydrolase  34.58 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2126  hypothetical protein  34.58 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000279259  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0507  metal dependent phosphohydrolase  33.96 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1835  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
212 aa  107  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.930216  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0366  metal dependent phosphohydrolase  41.36 
 
 
239 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.865468  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1158  metal dependent phosphohydrolase  36.73 
 
 
214 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0922  hypothetical protein  35.02 
 
 
231 aa  95.9  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.679798  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3954  metal dependent phosphohydrolase  34.3 
 
 
216 aa  95.5  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394521  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1457  hypothetical protein  34.63 
 
 
233 aa  95.1  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2224  metal dependent phosphohydrolase  36.18 
 
 
221 aa  95.1  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1006  metal dependent phosphohydrolase  36.73 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0465663  normal  0.366777 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4767  metal dependent phosphohydrolase  35.08 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126983  hitchhiker  0.00228546 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1681  hypothetical protein  34.1 
 
 
231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0610644 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1687  metal dependent phosphohydrolase  34.1 
 
 
231 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.138393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2739  hypothetical protein  35.02 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1223  hypothetical protein  34.1 
 
 
231 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.239453  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2194  hypothetical protein  34.1 
 
 
231 aa  94  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000183278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2064  hypothetical protein  36 
 
 
226 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0016347  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1748  HD superfamily hydrolase  32.66 
 
 
219 aa  92.8  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3492  metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 
236 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.866996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3615  metal dependent phosphohydrolase  32.84 
 
 
236 aa  90.1  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1237  metal dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.753462  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1183  metal-dependent phosphohydrolase  31.48 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2335  metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 
212 aa  88.6  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000568  metal-dependent phosphohydrolase  34.22 
 
 
212 aa  88.2  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05316  hypothetical protein  33.16 
 
 
217 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2427  metal dependent phosphohydrolase  32.71 
 
 
192 aa  86.3  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09449  HD superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03035)  33.93 
 
 
228 aa  85.9  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7497  metal-dependent phosphohydrolase  34.16 
 
 
214 aa  85.5  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.32308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1531  metal dependent phosphohydrolase  32.64 
 
 
214 aa  85.1  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2152  hypothetical protein  33.8 
 
 
231 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1248  hypothetical protein  33.8 
 
 
231 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.820142  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0996  HD domain protein  33.16 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2552  hypothetical protein  33 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.427776 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2209  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.796217  normal  0.438715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3045  metal dependent phosphohydrolase  30.99 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581871  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1126  hypothetical protein  33.8 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010564  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2156  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.148177 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1501  metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 
198 aa  81.3  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1513  putative metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0702104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0861  metal-dependent phosphohydrolase  32.64 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.467679 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0696  metal dependent phosphohydrolase  36.52 
 
 
218 aa  79  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3195  metal dependent phosphohydrolase  32.32 
 
 
246 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7189  normal  0.125641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2524  HD domain-containing protein  32.29 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00879841  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4131  metal dependent phosphohydrolase, HD region  35.08 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3253  hypothetical protein  39.44 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1508  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2059  metal dependent phosphohydrolase, HD region  33.49 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5268  metal dependent phosphohydrolase  32.29 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.221886 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00440  conserved hypothetical protein  38.66 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0533687  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2470  metal dependent phosphohydrolase  36.15 
 
 
282 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0543  metal dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0901  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 
224 aa  59.3  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0344  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3081  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.323647  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3163  metal dependent phosphohydrolase  30.82 
 
 
201 aa  48.5  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1197  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000267676  hitchhiker  0.00000595914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5182  hypothetical protein  28.69 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>