92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0996 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0996  HD domain protein  100 
 
 
219 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0861  metal-dependent phosphohydrolase  85.84 
 
 
219 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.467679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4767  metal dependent phosphohydrolase  63.08 
 
 
214 aa  290  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126983  hitchhiker  0.00228546 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7497  metal-dependent phosphohydrolase  64.95 
 
 
214 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.32308 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2224  metal dependent phosphohydrolase  62.2 
 
 
221 aa  264  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3954  metal dependent phosphohydrolase  60.47 
 
 
216 aa  258  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4131  metal dependent phosphohydrolase, HD region  58.85 
 
 
222 aa  250  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1457  hypothetical protein  58.14 
 
 
233 aa  249  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1158  metal dependent phosphohydrolase  59.79 
 
 
214 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0696  metal dependent phosphohydrolase  58.82 
 
 
218 aa  242  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1006  metal dependent phosphohydrolase  59.79 
 
 
214 aa  241  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0465663  normal  0.366777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3195  metal dependent phosphohydrolase  49.77 
 
 
246 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7189  normal  0.125641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2524  HD domain-containing protein  49.77 
 
 
218 aa  231  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00879841  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5268  metal dependent phosphohydrolase  61.24 
 
 
225 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.221886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1531  metal dependent phosphohydrolase  47.42 
 
 
214 aa  182  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2059  metal dependent phosphohydrolase, HD region  50 
 
 
251 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3492  metal dependent phosphohydrolase  48.47 
 
 
236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.866996  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0366  metal dependent phosphohydrolase  45.71 
 
 
239 aa  170  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.865468  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2552  hypothetical protein  46.07 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.427776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2064  hypothetical protein  44.39 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0016347  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1126  hypothetical protein  44.39 
 
 
231 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010564  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2739  hypothetical protein  44.67 
 
 
231 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3615  metal dependent phosphohydrolase  47.18 
 
 
236 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1681  hypothetical protein  44.67 
 
 
231 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1223  hypothetical protein  44.67 
 
 
231 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.239453  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2194  hypothetical protein  44.67 
 
 
231 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000183278  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1687  metal dependent phosphohydrolase  44.67 
 
 
231 aa  159  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.138393  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000568  metal-dependent phosphohydrolase  39.9 
 
 
212 aa  158  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0922  hypothetical protein  44.16 
 
 
231 aa  157  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.679798  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1248  hypothetical protein  43.88 
 
 
231 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.820142  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05316  hypothetical protein  39.58 
 
 
217 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2152  hypothetical protein  43.88 
 
 
231 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2156  hypothetical protein  43.88 
 
 
231 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.148177 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2209  hypothetical protein  43.37 
 
 
231 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.796217  normal  0.438715 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1237  metal dependent phosphohydrolase  41.8 
 
 
212 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.753462  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2335  metal dependent phosphohydrolase  41.27 
 
 
212 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1513  putative metal dependent phosphohydrolase  38.35 
 
 
210 aa  149  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0702104  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0507  metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 
206 aa  142  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1162  metal dependent phosphohydrolase  39.36 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.031643  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03700  metal-dependent phosphohydrolase  35.9 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0267  metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 
214 aa  112  5e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1508  metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 
199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0367  metal dependent phosphohydrolase  34.02 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00363061  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6614  metal dependent phosphohydrolase  34.85 
 
 
222 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.0170307 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1612  metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 
215 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1999  metal dependent phosphohydrolase  33.83 
 
 
215 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3146  HD domain protein  32.84 
 
 
215 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000400766  normal  0.0545051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2172  HD domain protein  32.34 
 
 
215 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.763705  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0221  metal dependent phosphohydrolase  34.34 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2163  HD domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168694  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2427  metal dependent phosphohydrolase  32.98 
 
 
192 aa  99.8  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2009  HD domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0187845  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1963  HD superfamily hydrolase  33.33 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2189  HD domain protein  33.33 
 
 
215 aa  99  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1981  HD superfamily hydrolase  33.33 
 
 
215 aa  99  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00267422  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1501  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
198 aa  99  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1644  metal dependent phosphohydrolase  32.29 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2307  HD domain protein  32.84 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00857429  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2132  metal dependent phosphohydrolase  34.65 
 
 
265 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2224  HD domain-containing protein  32.84 
 
 
215 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0142488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0967  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 
217 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0908  HD domain-containing protein  33.33 
 
 
203 aa  92.4  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1696  HD domain-containing protein  31 
 
 
217 aa  91.7  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3005  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  33.67 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.350219  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1102  metal-dependent phosphohydrolase  29.22 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000240201  normal  0.650073 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2575  metal dependent phosphohydrolase  31.66 
 
 
216 aa  85.9  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0644957  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1094  metal-dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 
215 aa  85.5  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1760  HD domain-containing protein  30.3 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0857727  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0195  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  32.14 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.892271  normal  0.262297 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2164  metal-dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2126  hypothetical protein  31.61 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000279259  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1835  metal dependent phosphohydrolase  30.11 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.930216  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1183  metal-dependent phosphohydrolase  31.77 
 
 
212 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7743  predicted protein  30.99 
 
 
222 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394853  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3253  hypothetical protein  44.09 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3045  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581871  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0299  HD superfamily hydrolase  28.43 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.329827  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0180  HD superfamily hydrolase  28.99 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000181993 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0935  metal dependent phosphohydrolase  26.77 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.462816  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2470  metal dependent phosphohydrolase  32.07 
 
 
282 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0901  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09449  HD superfamily hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03035)  35.79 
 
 
228 aa  55.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1748  HD superfamily hydrolase  26.56 
 
 
219 aa  51.6  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0344  metal dependent phosphohydrolase  31.19 
 
 
228 aa  49.3  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0543  metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 
221 aa  48.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1197  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 
230 aa  46.2  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000267676  hitchhiker  0.00000595914 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00440  conserved hypothetical protein  35.8 
 
 
168 aa  46.2  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0533687  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3081  metal dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 
239 aa  45.4  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.323647  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1154  metal dependent phosphohydrolase  36.22 
 
 
178 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0393  metal dependent phosphohydrolase  26.92 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2787  metal dependent phosphohydrolase  26.11 
 
 
196 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 
526 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>