More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0271 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0271  flagellar motor protein MotB  100 
 
 		 397 aa  809    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0757415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0333  flagellar motor protein MotB  54.4 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0365  flagellar motor protein MotB  55.45 
 
 		 443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412756  normal  0.472928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0756  flagellar motor protein MotB  52.37 
 
 		 444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0284  flagellar motor protein MotB  43.76 
 
 		 452 aa  334  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4198  flagellar motor protein MotB  47.3 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416203  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1144  flagellar motor protein MotB  44.42 
 
 		 366 aa  316  4e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3223  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0223192  normal  0.943443 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2687  OmpA/MotB domain-containing protein  37.71 
 
 		 416 aa  269  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.826191  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1679  OmpA/MotB domain-containing protein  39.77 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0303068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1107  flagellar motor protein MotB  38.55 
 
 		 423 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0037  OmpA/MotB domain protein  38.28 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1127  putative flagellar motor protein MotB  34.73 
 
 		 357 aa  210  4e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0631  OmpA/MotB domain-containing protein  57.26 
 
 		 468 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  0.662195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0642  OmpA/MotB domain protein  57.26 
 
 		 462 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0469396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0610  OmpA/MotB domain protein  56.41 
 
 		 470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0096444  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0226  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174216  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1901  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3817  flagellar motor protein MotB  42.02 
 
 		 335 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3453  OmpA/MotB domain protein  56.72 
 
 		 368 aa  89.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47019 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0180  flagellar motor protein MotB  39.66 
 
 		 339 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0167  flagellar motor protein MotB  39.66 
 
 		 339 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1321  chemotaxis MotB protein  34.01 
 
 		 290 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0117  flagellar motor protein MotB  46.74 
 
 		 335 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2976  flagellar motor protein MotB  56.92 
 
 		 369 aa  87  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103067 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2267  flagellar motor protein MotB  30.73 
 
 		 312 aa  86.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2239  flagellar motor protein MotB  30.73 
 
 		 312 aa  86.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3184  flagellar motor protein MotB  60 
 
 		 344 aa  86.7  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12888  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3857  flagellar motor protein MotB  60 
 
 		 340 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.347462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0079  flagellar motor protein MotB  60 
 
 		 340 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3938  flagellar motor protein MotB  60 
 
 		 340 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.29 
 
 		 264 aa  86.3  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.300073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3356  flagellar motor protein MotB  59.32 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828163  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1434  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2873  chemotaxis signal transduction protein CheY  39.17 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1555  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00240809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0625  flagellar motor protein MotB  58.46 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1308  flagellar motor protein MotB  29.89 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0163  flagellar motor protein MotB  58.33 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724048  normal  0.748844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2791  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.1 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2853  flagellar motor protein MotB  57.63 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0236  flagellar motor protein MotB  57.63 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0254  flagellar motor protein MotB  57.63 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1978  OmpA/MotB domain-containing protein  48.81 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0364656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1939  flagellar motor protein MotB  31.93 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3631  OmpA/MotB  33.77 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.77241  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3688  flagellar motor protein MotB  38.14 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5682  flagellar motor protein MotB  38.79 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0513  flagellar motor protein MotB  56.92 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4904  flagellar motor protein MotB  56.92 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4780  flagellar motor protein MotB  56.92 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1843  OmpA/MotB  33.95 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2986  OmpA/MotB domain-containing protein  60 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65430  flagellar motor protein MotB  61.4 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4666  OmpA/MotB domain-containing protein  35.95 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3447  OmpA/MotB domain-containing protein  32.47 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4696  flagellar motor protein MotB  61.4 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24330  Flagellar motor protein  60 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4957  flagellar motor protein MotB  56.92 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0562  flagellar motor protein MotB  55.38 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03067  flagellar motor protein MotB  55.38 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4952  chemotaxis motB protein  55.38 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457077  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  30.23 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0438  flagellar motor protein MotB  52.31 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3946  OmpA/MotB domain-containing protein  33.12 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1539  flagellar motor protein MotB  44.94 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2778  OmpA/MotB domain-containing protein  56.45 
 
 		 319 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4158  flagellar motor protein MotB  30.39 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1511  flagellar motor protein MotB  56.67 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0155028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0603  OmpA/MotB domain-containing protein  35.59 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4172  chemotaxis protein MotB  64.44 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4046  flagellar motor protein MotB  30.39 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.475556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0049  OmpA/MotB  35.34 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001165  Flagellar motor rotation protein MotB  35.22 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2919  OmpA/MotB  33.78 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0200  hypothetical protein  37.61 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0382119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0731  hypothetical protein  37.61 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0055  OmpA/MotB domain-containing protein  30.72 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1410  flagellar motor protein MotB  28.09 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0723  flagellar motor protein MotB  37.59 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1244  flagellar motor protein MotB  53.97 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1748  flagellar motor protein MotB  52.38 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.540445  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2962  putative chemotaxis MotB protein  34.09 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1504  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.962914  normal  0.610699 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2826  flagellar motor protein MotB  52.38 
 
 		 421 aa  76.3  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.156984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1637  flagellar motor protein MotB  52.38 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04949  flagellar motor protein  35.71 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1302  putative chemotaxis MotB protein  32.98 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5298  OmpA/MotB domain protein  34.59 
 
 		 277 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1036  OmpA/MotB domain protein  26.82 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0258  hypothetical protein  31.52 
 
 		 256 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4831  OmpA/MotB domain-containing protein  34.59 
 
 		 277 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.540375 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0284  hypothetical protein  31.52 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.179878  normal  0.584147 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0264  hypothetical protein  31.52 
 
 		 256 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0662  hypothetical protein  36.75 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4409  OmpA/MotB domain-containing protein  33.13 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1751  OmpA/MotB domain protein  61.82 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0290183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1295  flagellar motor protein MotB  61.82 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00197011  hitchhiker  0.000000685167 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5607  flagellar motor protein MotB  65.45 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707499  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1985  flagellar motor protein MotB  61.82 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000595029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>