27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6197 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1025  ribosomal protein S18  50.42 
 
 		 754 aa  715    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000586584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6197  Alpha-glucuronidase  100 
 
 		 707 aa  1462    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1079  Alpha-glucuronidase  53.22 
 
 		 726 aa  779    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0797  Alpha-glucuronidase  68.8 
 
 		 710 aa  1030    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000695793  normal  0.131309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03852  alpha-glucuronidase  52.2 
 
 		 731 aa  714    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4316  Alpha-glucuronidase  52.35 
 
 		 730 aa  743    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1993  Alpha-glucuronidase  50.92 
 
 		 717 aa  734    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1836  Alpha-glucuronidase  52.89 
 
 		 709 aa  714    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2706  Alpha-glucuronidase  45.01 
 
 		 683 aa  549  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0141  Glycosyl hydrolase 67 middle domain protein  40.83 
 
 		 697 aa  520  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07070  alpha-glucuronidase  40.32 
 
 		 1154 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.509455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0963  Alpha-glucosiduronase  41.65 
 
 		 826 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0060  Alpha-glucuronidase  45.95 
 
 		 690 aa  487  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0854  Alpha-glucuronidase  42.13 
 
 		 693 aa  479  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09286  alpha-glucuronidase (Eurofung)  39.09 
 
 		 847 aa  466  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0490626  normal  0.152371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0871  Alpha-glucuronidase  39.19 
 
 		 688 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.299149  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0891  Alpha-glucuronidase  42.88 
 
 		 674 aa  464  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1714  Alpha-glucuronidase  43.79 
 
 		 685 aa  465  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00270664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3158  Alpha-glucuronidase  39.33 
 
 		 684 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0869  Alpha-glucuronidase  42.55 
 
 		 674 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2394  Alpha-glucuronidase  42.07 
 
 		 683 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.278359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1975  Alpha-glucuronidase  41.47 
 
 		 650 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33210  alpha-glucuronidase  40.13 
 
 		 705 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.807912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3824  Alpha-glucuronidase  40.99 
 
 		 695 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196614  normal  0.129894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2984  Alpha-glucuronidase  38.05 
 
 		 677 aa  385  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.189953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0371  Alpha-glucuronidase  39.05 
 
 		 679 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4325  hypothetical protein  23.77 
 
 		 806 aa  45.8  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>