26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0869 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0060  Alpha-glucuronidase  54.73 
 
 
690 aa  739    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0869  Alpha-glucuronidase  100 
 
 
674 aa  1392    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3158  Alpha-glucuronidase  57.58 
 
 
684 aa  709    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0854  Alpha-glucuronidase  63.32 
 
 
693 aa  880    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0891  Alpha-glucuronidase  98.07 
 
 
674 aa  1359    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0141  Glycosyl hydrolase 67 middle domain protein  56.03 
 
 
697 aa  783    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2706  Alpha-glucuronidase  55.73 
 
 
683 aa  786    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1714  Alpha-glucuronidase  68.68 
 
 
685 aa  956    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00270664  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2984  Alpha-glucuronidase  51.18 
 
 
677 aa  589  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.189953  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1975  Alpha-glucuronidase  49.75 
 
 
650 aa  591  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2394  Alpha-glucuronidase  50.78 
 
 
683 aa  585  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.278359  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1079  Alpha-glucuronidase  46.07 
 
 
726 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0371  Alpha-glucuronidase  49.49 
 
 
679 aa  584  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0963  Alpha-glucosiduronase  44.07 
 
 
826 aa  572  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3824  Alpha-glucuronidase  45.19 
 
 
695 aa  568  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196614  normal  0.129894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33210  alpha-glucuronidase  47.64 
 
 
705 aa  559  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.807912  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1025  ribosomal protein S18  45.88 
 
 
754 aa  555  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000586584  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1993  Alpha-glucuronidase  41.65 
 
 
717 aa  541  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0871  Alpha-glucuronidase  43.4 
 
 
688 aa  535  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.299149  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03852  alpha-glucuronidase  41.38 
 
 
731 aa  521  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09286  alpha-glucuronidase (Eurofung)  45.52 
 
 
847 aa  520  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0490626  normal  0.152371 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4316  Alpha-glucuronidase  43.99 
 
 
730 aa  514  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1836  Alpha-glucuronidase  41.5 
 
 
709 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6197  Alpha-glucuronidase  42.55 
 
 
707 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0797  Alpha-glucuronidase  42.76 
 
 
710 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000695793  normal  0.131309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07070  alpha-glucuronidase  34.8 
 
 
1154 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.509455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>