26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2706 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1714  Alpha-glucuronidase  55.78 
 
 
685 aa  768    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00270664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2706  Alpha-glucuronidase  100 
 
 
683 aa  1426    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0060  Alpha-glucuronidase  64.87 
 
 
690 aa  790    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2394  Alpha-glucuronidase  54.31 
 
 
683 aa  646    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.278359  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3824  Alpha-glucuronidase  56.37 
 
 
695 aa  655    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196614  normal  0.129894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1975  Alpha-glucuronidase  54.15 
 
 
650 aa  687    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33210  alpha-glucuronidase  49.42 
 
 
705 aa  642    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.807912  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0854  Alpha-glucuronidase  57.16 
 
 
693 aa  781    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0141  Glycosyl hydrolase 67 middle domain protein  60.99 
 
 
697 aa  889    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2984  Alpha-glucuronidase  54.84 
 
 
677 aa  649    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.189953  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0891  Alpha-glucuronidase  56.45 
 
 
674 aa  755    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3158  Alpha-glucuronidase  53.28 
 
 
684 aa  737    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0869  Alpha-glucuronidase  55.73 
 
 
674 aa  746    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0371  Alpha-glucuronidase  53.1 
 
 
679 aa  630  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0963  Alpha-glucosiduronase  47.12 
 
 
826 aa  619  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1079  Alpha-glucuronidase  47.85 
 
 
726 aa  611  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1993  Alpha-glucuronidase  44.36 
 
 
717 aa  580  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0871  Alpha-glucuronidase  44.46 
 
 
688 aa  559  1e-158  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.299149  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1836  Alpha-glucuronidase  44.69 
 
 
709 aa  556  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0162168 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09286  alpha-glucuronidase (Eurofung)  43.85 
 
 
847 aa  557  1e-157  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0490626  normal  0.152371 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1025  ribosomal protein S18  44.12 
 
 
754 aa  552  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000586584  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03852  alpha-glucuronidase  45.48 
 
 
731 aa  553  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6197  Alpha-glucuronidase  45.01 
 
 
707 aa  549  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4316  Alpha-glucuronidase  43.17 
 
 
730 aa  549  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0797  Alpha-glucuronidase  43.22 
 
 
710 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000695793  normal  0.131309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07070  alpha-glucuronidase  37.83 
 
 
1154 aa  431  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.509455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>