26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0871 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0871  Alpha-glucuronidase  100 
 
 
688 aa  1405    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.299149  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1079  Alpha-glucuronidase  46.16 
 
 
726 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0141  Glycosyl hydrolase 67 middle domain protein  45.1 
 
 
697 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2706  Alpha-glucuronidase  44.7 
 
 
683 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1993  Alpha-glucuronidase  41.24 
 
 
717 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1025  ribosomal protein S18  41.07 
 
 
754 aa  523  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000586584  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1714  Alpha-glucuronidase  40.54 
 
 
685 aa  519  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00270664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0060  Alpha-glucuronidase  47.31 
 
 
690 aa  506  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0854  Alpha-glucuronidase  40.17 
 
 
693 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4316  Alpha-glucuronidase  41.58 
 
 
730 aa  507  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0891  Alpha-glucuronidase  43.84 
 
 
674 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1836  Alpha-glucuronidase  42.12 
 
 
709 aa  501  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0869  Alpha-glucuronidase  43.4 
 
 
674 aa  499  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0963  Alpha-glucosiduronase  41.44 
 
 
826 aa  500  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03852  alpha-glucuronidase  43.52 
 
 
731 aa  497  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6197  Alpha-glucuronidase  39.19 
 
 
707 aa  472  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3158  Alpha-glucuronidase  42.76 
 
 
684 aa  475  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09286  alpha-glucuronidase (Eurofung)  40.42 
 
 
847 aa  472  1.0000000000000001e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0490626  normal  0.152371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0797  Alpha-glucuronidase  40.17 
 
 
710 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000695793  normal  0.131309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1975  Alpha-glucuronidase  45.32 
 
 
650 aa  461  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2984  Alpha-glucuronidase  44.24 
 
 
677 aa  451  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.189953  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0371  Alpha-glucuronidase  41.2 
 
 
679 aa  432  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2394  Alpha-glucuronidase  42.12 
 
 
683 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.278359  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3824  Alpha-glucuronidase  41.98 
 
 
695 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196614  normal  0.129894 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07070  alpha-glucuronidase  36.35 
 
 
1154 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.509455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33210  alpha-glucuronidase  41.19 
 
 
705 aa  414  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.807912  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>