26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3824 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2394  Alpha-glucuronidase  52.38 
 
 		 683 aa  687    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.278359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2984  Alpha-glucuronidase  62.61 
 
 		 677 aa  787    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.189953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0371  Alpha-glucuronidase  59.42 
 
 		 679 aa  785    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33210  alpha-glucuronidase  59.63 
 
 		 705 aa  773    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.807912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0060  Alpha-glucuronidase  54.02 
 
 		 690 aa  649    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0141  Glycosyl hydrolase 67 middle domain protein  49.51 
 
 		 697 aa  645    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2706  Alpha-glucuronidase  56.54 
 
 		 683 aa  684    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1975  Alpha-glucuronidase  62.03 
 
 		 650 aa  818    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3824  Alpha-glucuronidase  100 
 
 		 695 aa  1412    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196614  normal  0.129894 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3158  Alpha-glucuronidase  49.1 
 
 		 684 aa  588  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0854  Alpha-glucuronidase  45.77 
 
 		 693 aa  587  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0891  Alpha-glucuronidase  46.37 
 
 		 674 aa  566  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1714  Alpha-glucuronidase  47.04 
 
 		 685 aa  566  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00270664  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0869  Alpha-glucuronidase  45.48 
 
 		 674 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0963  Alpha-glucosiduronase  46.69 
 
 		 826 aa  492  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09286  alpha-glucuronidase (Eurofung)  44.48 
 
 		 847 aa  466  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0490626  normal  0.152371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0871  Alpha-glucuronidase  43.4 
 
 		 688 aa  445  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.299149  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1079  Alpha-glucuronidase  42.61 
 
 		 726 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1025  ribosomal protein S18  39.26 
 
 		 754 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000586584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6197  Alpha-glucuronidase  41.72 
 
 		 707 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1993  Alpha-glucuronidase  36.99 
 
 		 717 aa  409  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4316  Alpha-glucuronidase  39.49 
 
 		 730 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1836  Alpha-glucuronidase  38.47 
 
 		 709 aa  402  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0797  Alpha-glucuronidase  38.92 
 
 		 710 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000695793  normal  0.131309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03852  alpha-glucuronidase  40.83 
 
 		 731 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07070  alpha-glucuronidase  35.4 
 
 		 1154 aa  332  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.509455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>