30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0963 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_09286  alpha-glucuronidase (Eurofung)  48.35 
 
 		 847 aa  789    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0490626  normal  0.152371 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0963  Alpha-glucosiduronase  100 
 
 		 826 aa  1707    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2706  Alpha-glucuronidase  47.12 
 
 		 683 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0141  Glycosyl hydrolase 67 middle domain protein  43.99 
 
 		 697 aa  601  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0060  Alpha-glucuronidase  52.71 
 
 		 690 aa  576  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1714  Alpha-glucuronidase  43.57 
 
 		 685 aa  560  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00270664  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0854  Alpha-glucuronidase  43 
 
 		 693 aa  548  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0891  Alpha-glucuronidase  44.51 
 
 		 674 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0869  Alpha-glucuronidase  44.07 
 
 		 674 aa  532  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1975  Alpha-glucuronidase  43.21 
 
 		 650 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3158  Alpha-glucuronidase  40.27 
 
 		 684 aa  514  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2394  Alpha-glucuronidase  47.3 
 
 		 683 aa  507  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.278359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1079  Alpha-glucuronidase  40.72 
 
 		 726 aa  502  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33210  alpha-glucuronidase  42.55 
 
 		 705 aa  501  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.807912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6197  Alpha-glucuronidase  41.65 
 
 		 707 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0871  Alpha-glucuronidase  41.44 
 
 		 688 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.299149  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2984  Alpha-glucuronidase  47.43 
 
 		 677 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.189953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0371  Alpha-glucuronidase  46.11 
 
 		 679 aa  492  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3824  Alpha-glucuronidase  46.35 
 
 		 695 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196614  normal  0.129894 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03852  alpha-glucuronidase  42.23 
 
 		 731 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1993  Alpha-glucuronidase  38.56 
 
 		 717 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1836  Alpha-glucuronidase  41.68 
 
 		 709 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4316  Alpha-glucuronidase  39.5 
 
 		 730 aa  461  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1025  ribosomal protein S18  37.66 
 
 		 754 aa  446  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000586584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0797  Alpha-glucuronidase  38.31 
 
 		 710 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000695793  normal  0.131309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07070  alpha-glucuronidase  33.7 
 
 		 1154 aa  352  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.509455 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  27.03 
 
 		 681 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3592  Hemolysin-type calcium-binding region  29.94 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0868117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4592  hypothetical protein  35.82 
 
 		 528 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  34.85 
 
 		 1727 aa  50.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>