21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4457 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4457  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  670    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2484  hypothetical protein  37.39 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3223  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.86 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1065  DnaJ domain protein  29.17 
 
 		 373 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744662  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1752  hypothetical protein  28.11 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5014  heat shock protein DnaJ-like  31.05 
 
 		 375 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.924768  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5846  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.05 
 
 		 375 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4333  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.62 
 
 		 375 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.609788  normal  0.595593 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5083  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.29 
 
 		 372 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1515  heat shock protein DnaJ domain protein  32.28 
 
 		 366 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1464  hypothetical protein  32.36 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000176252 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5259  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.2 
 
 		 369 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0912  DnaJ domain-containing protein  27.86 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3003  hypothetical protein  29.71 
 
 		 371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3396  DnaJ domain-containing protein  23.86 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01879  DnaJ domain protein  26.18 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.052076  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1406  DnaJ domain-containing protein  31.39 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1294  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6654  hypothetical protein  27.09 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2931  heat shock protein DnaJ domain protein  41.27 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3165  heat shock protein DnaJ domain protein  41.27 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3168  DnaJ domain-containing protein  41.51 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>