21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2484 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2484  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  712    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4457  hypothetical protein  37.83 
 
 
334 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3223  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30 
 
 
370 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1065  DnaJ domain protein  27.54 
 
 
373 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744662  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5014  heat shock protein DnaJ-like  28.53 
 
 
375 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.924768  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5846  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.53 
 
 
375 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648225  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4333  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.73 
 
 
375 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.609788  normal  0.595593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1752  hypothetical protein  26.79 
 
 
392 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3003  hypothetical protein  29.75 
 
 
371 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5083  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.97 
 
 
372 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0912  DnaJ domain-containing protein  42.59 
 
 
373 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5259  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.61 
 
 
369 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1515  heat shock protein DnaJ domain protein  40 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148298  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1464  hypothetical protein  37.76 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000176252 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1406  DnaJ domain-containing protein  26.43 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1294  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01879  DnaJ domain protein  25.61 
 
 
371 aa  67  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.052076  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3396  DnaJ domain-containing protein  23.5 
 
 
400 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6654  hypothetical protein  23.77 
 
 
351 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3165  heat shock protein DnaJ domain protein  30.69 
 
 
357 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2931  heat shock protein DnaJ domain protein  30.69 
 
 
357 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.5 
 
 
481 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>