20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6654 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6654  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  709    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1406  DnaJ domain-containing protein  24.48 
 
 		 327 aa  92.8  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1294  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5014  heat shock protein DnaJ-like  28.38 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.924768  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5846  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.38 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1752  hypothetical protein  28.19 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3223  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.85 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5083  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.76 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5259  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.23 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3003  hypothetical protein  26.09 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4457  hypothetical protein  26.97 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2484  hypothetical protein  24.63 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1065  DnaJ domain protein  22.98 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0912  DnaJ domain-containing protein  29.66 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3396  DnaJ domain-containing protein  23.29 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01879  DnaJ domain protein  37.21 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.052076  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1515  heat shock protein DnaJ domain protein  23.05 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148298  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3168  DnaJ domain-containing protein  28.12 
 
 		 402 aa  50.1  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4333  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.61 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.609788  normal  0.595593 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1464  hypothetical protein  23.05 
 
 		 366 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000176252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2319  hypothetical protein  36.36 
 
 		 442 aa  42.7  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.722749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>