19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1406 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1406  DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
327 aa  666    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1294  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6654  hypothetical protein  23.71 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2484  hypothetical protein  26.43 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4457  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0912  DnaJ domain-containing protein  29.94 
 
 
373 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1065  DnaJ domain protein  32.23 
 
 
373 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744662  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1752  hypothetical protein  28.02 
 
 
392 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3223  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  21.94 
 
 
370 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5083  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  21.81 
 
 
372 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5846  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  23.12 
 
 
375 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648225  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5014  heat shock protein DnaJ-like  23.12 
 
 
375 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.924768  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4333  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  21.35 
 
 
375 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.609788  normal  0.595593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3003  hypothetical protein  25 
 
 
371 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3396  DnaJ domain-containing protein  30 
 
 
400 aa  49.7  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5259  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  22.7 
 
 
369 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01879  DnaJ domain protein  26.23 
 
 
371 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.052076  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1464  hypothetical protein  29.82 
 
 
366 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000176252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1515  heat shock protein DnaJ domain protein  28.68 
 
 
366 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148298  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.37 
 
 
481 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>