25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3223 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5083  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  97.33 
 
 
372 aa  683    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3223  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
370 aa  746    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5014  heat shock protein DnaJ-like  86.93 
 
 
375 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.924768  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5846  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  86.93 
 
 
375 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648225  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4333  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  86.93 
 
 
375 aa  607  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.609788  normal  0.595593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3003  hypothetical protein  75.47 
 
 
371 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5259  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  74.13 
 
 
369 aa  504  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1515  heat shock protein DnaJ domain protein  46.56 
 
 
366 aa  249  7e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148298  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1464  hypothetical protein  46.01 
 
 
366 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000176252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1065  DnaJ domain protein  38.15 
 
 
373 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744662  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1752  hypothetical protein  35.81 
 
 
392 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0912  DnaJ domain-containing protein  35.48 
 
 
373 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01879  DnaJ domain protein  32.01 
 
 
371 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.052076  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4457  hypothetical protein  32.57 
 
 
334 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2484  hypothetical protein  30 
 
 
349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3396  DnaJ domain-containing protein  33.12 
 
 
400 aa  124  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1406  DnaJ domain-containing protein  21.94 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1294  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2931  heat shock protein DnaJ domain protein  39.44 
 
 
357 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3165  heat shock protein DnaJ domain protein  39.44 
 
 
357 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0813  heat shock protein DnaJ-like  25.93 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.759409  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 
962 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6873  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.34 
 
 
248 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.55 
 
 
481 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120001  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6654  hypothetical protein  31.52 
 
 
351 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2175  hypothetical protein  33.7 
 
 
437 aa  42.7  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>