20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1752 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1752  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  794    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3003  hypothetical protein  37.23 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3223  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.81 
 
 		 370 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5083  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.17 
 
 		 372 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5014  heat shock protein DnaJ-like  34.2 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.924768  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5846  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.2 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5259  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.43 
 
 		 369 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4333  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.07 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.609788  normal  0.595593 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01879  DnaJ domain protein  33.33 
 
 		 371 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.052076  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1464  hypothetical protein  31.81 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000176252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1065  DnaJ domain protein  29.66 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1515  heat shock protein DnaJ domain protein  31.64 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0912  DnaJ domain-containing protein  29.38 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4457  hypothetical protein  26.41 
 
 		 334 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2484  hypothetical protein  26.79 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3396  DnaJ domain-containing protein  27.42 
 
 		 400 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6654  hypothetical protein  27.85 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1406  DnaJ domain-containing protein  28.02 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1294  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2638  hypothetical protein  39.22 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.308384 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2319  hypothetical protein  43.75 
 
 		 442 aa  42.7  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.722749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>