27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0912 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0912  DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
373 aa  752    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1065  DnaJ domain protein  82.31 
 
 
373 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1515  heat shock protein DnaJ domain protein  37.47 
 
 
366 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148298  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1464  hypothetical protein  37.19 
 
 
366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000176252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3003  hypothetical protein  34.9 
 
 
371 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5259  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.29 
 
 
369 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5014  heat shock protein DnaJ-like  35.48 
 
 
375 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.924768  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5846  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.48 
 
 
375 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648225  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3223  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.19 
 
 
370 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5083  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.57 
 
 
372 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4333  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.9 
 
 
375 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.609788  normal  0.595593 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3396  DnaJ domain-containing protein  31.87 
 
 
400 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01879  DnaJ domain protein  29.97 
 
 
371 aa  146  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.052076  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1752  hypothetical protein  29.38 
 
 
392 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4457  hypothetical protein  27.58 
 
 
334 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2484  hypothetical protein  33.54 
 
 
349 aa  93.6  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1406  DnaJ domain-containing protein  32.17 
 
 
327 aa  63.2  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1294  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6654  hypothetical protein  29.22 
 
 
351 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0098  hypothetical protein  40.79 
 
 
276 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0307347 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6873  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.78 
 
 
248 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.73 
 
 
481 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120001  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0813  heat shock protein DnaJ-like  27.89 
 
 
347 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.759409  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0822  heat shock protein DnaJ-like protein  38.71 
 
 
635 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.77208  normal  0.437006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  25.95 
 
 
962 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2319  hypothetical protein  41.07 
 
 
442 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.722749  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2931  heat shock protein DnaJ domain protein  28.87 
 
 
357 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3165  heat shock protein DnaJ domain protein  28.87 
 
 
357 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>