22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1515 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1515  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 		 366 aa  728    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1464  hypothetical protein  93.99 
 
 		 366 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000176252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3003  hypothetical protein  47.79 
 
 		 371 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5259  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.24 
 
 		 369 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3223  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.56 
 
 		 370 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5014  heat shock protein DnaJ-like  46.69 
 
 		 375 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.924768  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5846  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.69 
 
 		 375 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4333  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.96 
 
 		 375 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.609788  normal  0.595593 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5083  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.41 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1065  DnaJ domain protein  38.23 
 
 		 373 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.744662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0912  DnaJ domain-containing protein  36.36 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1752  hypothetical protein  32.17 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4457  hypothetical protein  32.36 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01879  DnaJ domain protein  30.59 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.052076  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2484  hypothetical protein  32.37 
 
 		 349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3396  DnaJ domain-containing protein  32.39 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6654  hypothetical protein  24.66 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1406  DnaJ domain-containing protein  22.73 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.1294  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2931  heat shock protein DnaJ domain protein  37.76 
 
 		 357 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3165  heat shock protein DnaJ domain protein  37.76 
 
 		 357 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6873  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.33 
 
 		 248 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0813  heat shock protein DnaJ-like  29.59 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.759409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>