65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4164 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4164  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
356 aa  734    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4171  alpha/beta fold family hydrolase  37.62 
 
 
332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4011  alpha/beta fold family hydrolase  36.91 
 
 
332 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3844  prolyl aminopeptidase  36.91 
 
 
332 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4126  putative hydrolase, alpha/beta fold family  36.91 
 
 
332 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00083972 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4324  alpha/beta fold family hydrolase  36.91 
 
 
332 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3858  prolyl aminopeptidase  36.91 
 
 
332 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0501  alpha/beta hydrolase fold protein  33.24 
 
 
378 aa  224  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4235  putative hydrolase, alpha/beta fold family  37.3 
 
 
332 aa  222  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20570  alpha/beta hydrolase fold protein  35.24 
 
 
363 aa  219  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2801  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 
332 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1025  putative hydrolase, alpha/beta fold family  37.94 
 
 
332 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4212  putative hydrolase, alpha/beta fold family  37.62 
 
 
332 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3934  alpha/beta hydrolase fold  36.98 
 
 
332 aa  210  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.870458  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1582  Alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 
376 aa  206  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  36.28 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2148  alpha/beta fold family hydrolase  32.65 
 
 
343 aa  185  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.014973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2392  alpha/beta fold family hydrolase  32.65 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0864957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2226  alpha/beta fold family hydrolase  32.65 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2198  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 
343 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00385806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2409  hydrolase, alpha/beta fold family  32.07 
 
 
343 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2164  alpha/beta hydrolase  32.07 
 
 
343 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2422  alpha/beta fold family hydrolase  30.65 
 
 
343 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.157324  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4419  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 
399 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.582229  normal  0.372362 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1200  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
364 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1084  alpha/beta hydrolase fold  33.13 
 
 
335 aa  156  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0973  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
347 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4017  proline imino-peptidase  29.07 
 
 
353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4606  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
316 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.279333  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0279  hypothetical protein  24.09 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0626253  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0810  alpha/beta hydrolase fold protein  20.32 
 
 
314 aa  90.1  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000484628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  25.17 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  26.13 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  23.57 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  34.91 
 
 
296 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  23.18 
 
 
296 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1871  alpha/beta hydrolase fold protein  22.87 
 
 
332 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.725536 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  23.18 
 
 
296 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  34 
 
 
305 aa  49.7  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  25.73 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  21.48 
 
 
273 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  21.82 
 
 
278 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 
291 aa  47.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  28.03 
 
 
325 aa  47  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
280 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0586  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 
285 aa  46.6  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0592  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 
294 aa  46.2  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  36.59 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  30.3 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  27.69 
 
 
590 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  37.88 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  21.71 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  32.32 
 
 
292 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  21.71 
 
 
301 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  22.92 
 
 
289 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  21.68 
 
 
667 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  27.73 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  21.38 
 
 
301 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  21.38 
 
 
303 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  26.38 
 
 
301 aa  43.5  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  27.78 
 
 
327 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 
592 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  19.86 
 
 
276 aa  42.7  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  28.57 
 
 
323 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>