69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0279 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0279  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  655    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0626253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3858  prolyl aminopeptidase  29.03 
 
 
332 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4235  putative hydrolase, alpha/beta fold family  29.06 
 
 
332 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4324  alpha/beta fold family hydrolase  28.09 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4011  alpha/beta fold family hydrolase  28.09 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4126  putative hydrolase, alpha/beta fold family  28.09 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00083972 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3844  prolyl aminopeptidase  28.09 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2801  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4171  alpha/beta fold family hydrolase  28.79 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4212  putative hydrolase, alpha/beta fold family  29.23 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1025  putative hydrolase, alpha/beta fold family  29.23 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3934  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
332 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.870458  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0501  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 
378 aa  99  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4164  alpha/beta hydrolase fold protein  24.09 
 
 
356 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4419  alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 
399 aa  89.4  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.582229  normal  0.372362 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1200  alpha/beta hydrolase fold  22.05 
 
 
364 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20570  alpha/beta hydrolase fold protein  23 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  21.9 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4017  proline imino-peptidase  18.71 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2148  alpha/beta fold family hydrolase  22.29 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.014973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2226  alpha/beta fold family hydrolase  21.52 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2392  alpha/beta fold family hydrolase  21.52 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0864957  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2164  alpha/beta hydrolase  21.67 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2409  hydrolase, alpha/beta fold family  21.67 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1582  Alpha/beta hydrolase fold  21.2 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2422  alpha/beta fold family hydrolase  21.14 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.157324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2198  alpha/beta hydrolase fold  20.95 
 
 
343 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00385806  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  21.05 
 
 
328 aa  62.8  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1084  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 
335 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  21.67 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0973  alpha/beta hydrolase fold  21.27 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  23.53 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1807  hypothetical protein  24.91 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1808  hypothetical protein  24.91 
 
 
319 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0810  alpha/beta hydrolase fold protein  24.39 
 
 
314 aa  56.2  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000484628  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1871  alpha/beta hydrolase fold protein  21.69 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.725536 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  23.51 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  24.01 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  21.9 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  21.09 
 
 
286 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  23.32 
 
 
328 aa  49.7  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  23.61 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  21.83 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  27.42 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  17.27 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  27.05 
 
 
323 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  25.57 
 
 
278 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2838  proline iminopeptidase  21.35 
 
 
321 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00251437  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  21.4 
 
 
323 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  23.62 
 
 
316 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4606  alpha/beta hydrolase fold  19.93 
 
 
316 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.279333  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2835  proline iminopeptidase  20.12 
 
 
337 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  20.63 
 
 
302 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  22.22 
 
 
292 aa  46.6  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1122  proline iminopeptidase  27.35 
 
 
339 aa  46.6  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.29642  normal  0.0858208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  21.94 
 
 
329 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  21.4 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  19.52 
 
 
292 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0646  hydrolase, alpha/beta domain protein  28.57 
 
 
460 aa  45.1  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.291247 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  19.66 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  20.42 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  26.61 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  25.83 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  20.72 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  20 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  28.46 
 
 
323 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  21.03 
 
 
315 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0360  proline iminopeptidase  24.18 
 
 
316 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  28.44 
 
 
303 aa  42.7  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>