61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1871 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1871  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
332 aa  697    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.725536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1084  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  26.63 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1582  Alpha/beta hydrolase fold  21.85 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0501  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
378 aa  67  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2409  hydrolase, alpha/beta fold family  22.19 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2164  alpha/beta hydrolase  22.19 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2392  alpha/beta fold family hydrolase  21.67 
 
 
343 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0864957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2226  alpha/beta fold family hydrolase  21.67 
 
 
343 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2148  alpha/beta fold family hydrolase  21.67 
 
 
343 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.014973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2198  alpha/beta hydrolase fold  21.19 
 
 
343 aa  62.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00385806  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4419  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.582229  normal  0.372362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2422  alpha/beta fold family hydrolase  25.12 
 
 
343 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.157324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20570  alpha/beta hydrolase fold protein  30.16 
 
 
363 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4324  alpha/beta fold family hydrolase  33.02 
 
 
332 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3844  prolyl aminopeptidase  33.02 
 
 
332 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4126  putative hydrolase, alpha/beta fold family  33.02 
 
 
332 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00083972 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4011  alpha/beta fold family hydrolase  33.02 
 
 
332 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3934  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
332 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.870458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3858  prolyl aminopeptidase  32.08 
 
 
332 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0279  hypothetical protein  21.69 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0626253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4235  putative hydrolase, alpha/beta fold family  31.93 
 
 
332 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2801  alpha/beta hydrolase fold  34.74 
 
 
332 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4212  putative hydrolase, alpha/beta fold family  31.93 
 
 
332 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1200  alpha/beta hydrolase fold  23.45 
 
 
364 aa  55.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0973  alpha/beta hydrolase fold  21.65 
 
 
347 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4171  alpha/beta fold family hydrolase  32.41 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1025  putative hydrolase, alpha/beta fold family  31.93 
 
 
332 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0810  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000484628  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  23.3 
 
 
292 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.96 
 
 
588 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4017  proline imino-peptidase  34.78 
 
 
353 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 
342 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
342 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4606  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
316 aa  49.7  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.279333  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4164  alpha/beta hydrolase fold protein  22.87 
 
 
356 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3602  Alpha/beta hydrolase fold  21.84 
 
 
306 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.183144 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2723  alpha/beta fold family hydrolase  29.91 
 
 
176 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000984442  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
305 aa  46.2  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2752  hydrolase, alpha/beta fold family  29.91 
 
 
277 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00120661  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
340 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  25.95 
 
 
590 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 
293 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2702  hydrolase, alpha/beta fold family  29.63 
 
 
277 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000230217 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  22.53 
 
 
286 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  26.56 
 
 
254 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  29.29 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1305  hypothetical protein  26.62 
 
 
341 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236465  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 
287 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  29.29 
 
 
296 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  21.33 
 
 
282 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  22.47 
 
 
301 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  22.47 
 
 
303 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  22.47 
 
 
301 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  23.1 
 
 
286 aa  43.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 
592 aa  42.7  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  31.82 
 
 
263 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1033  hypothetical protein  24.85 
 
 
336 aa  42.7  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0782021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  22.47 
 
 
301 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>