14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1115 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1115  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  645    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415846  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2010  hypothetical protein  55.12 
 
 		 313 aa  333  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5597  hypothetical protein  45.05 
 
 		 311 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.872551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4333  hypothetical protein  40.26 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4377  hypothetical protein  38.73 
 
 		 317 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2590  chromosome segregation ATPase  30.89 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3459  hypothetical protein  31.6 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0353922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6526  hypothetical protein  25.95 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435938  normal  0.151944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4146  hypothetical protein  24.05 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185642 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0072  hypothetical protein  23.72 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01735  hypothetical protein  24.77 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.354262  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2187  hypothetical protein  25 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.619306  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08331  hypothetical protein  23.86 
 
 		 293 aa  53.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4571  hypothetical protein  23.51 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>