17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3459 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3459  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  603  9.999999999999999e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0353922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5597  hypothetical protein  33.22 
 
 
311 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.872551  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4333  hypothetical protein  30.35 
 
 
302 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2010  hypothetical protein  35.95 
 
 
313 aa  143  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4377  hypothetical protein  28.75 
 
 
317 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2590  chromosome segregation ATPase  34.12 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6526  hypothetical protein  29.21 
 
 
320 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435938  normal  0.151944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1115  hypothetical protein  31.6 
 
 
316 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415846  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4146  hypothetical protein  24.92 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.185642 
 
 
-
 
NC_002950  PG1387  hypothetical protein  22.07 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000827586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2187  hypothetical protein  26.43 
 
 
189 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.619306  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01735  hypothetical protein  20.9 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.354262  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08331  hypothetical protein  22.08 
 
 
293 aa  55.8  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4571  hypothetical protein  24.76 
 
 
293 aa  55.8  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1186  hypothetical protein  25.73 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0072  hypothetical protein  27.03 
 
 
321 aa  52.4  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.37 
 
 
1233 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>