14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4571 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4571  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  580  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1186  hypothetical protein  36.07 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08331  hypothetical protein  33.1 
 
 
293 aa  162  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01735  hypothetical protein  32.88 
 
 
294 aa  146  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.354262  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0072  hypothetical protein  32.48 
 
 
321 aa  132  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6526  hypothetical protein  25.83 
 
 
320 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435938  normal  0.151944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4146  hypothetical protein  28.77 
 
 
302 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.185642 
 
 
-
 
NC_002950  PG1387  hypothetical protein  25 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000827586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5597  hypothetical protein  26.15 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.872551  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4333  hypothetical protein  27.13 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4377  hypothetical protein  25.08 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2010  hypothetical protein  30.61 
 
 
313 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3459  hypothetical protein  24.37 
 
 
305 aa  49.7  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0353922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2590  chromosome segregation ATPase  28.91 
 
 
309 aa  42.4  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>