15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4377 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4377  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  642    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5597  hypothetical protein  50.32 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.872551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4333  hypothetical protein  44.13 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2010  hypothetical protein  42.76 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1115  hypothetical protein  40.34 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415846  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2590  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3459  hypothetical protein  29.25 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0353922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6526  hypothetical protein  29.82 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435938  normal  0.151944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4146  hypothetical protein  25.79 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185642 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2187  hypothetical protein  30.77 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.619306  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_002950  PG1387  hypothetical protein  24.47 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000827586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4571  hypothetical protein  25.08 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08331  hypothetical protein  25.6 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1186  hypothetical protein  23 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0072  hypothetical protein  22.92 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>