13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01735 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01735  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  589  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.354262  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08331  hypothetical protein  34.13 
 
 
293 aa  186  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4571  hypothetical protein  32.88 
 
 
293 aa  146  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0072  hypothetical protein  31.5 
 
 
321 aa  139  6e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1186  hypothetical protein  26.8 
 
 
308 aa  93.6  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1387  hypothetical protein  27.51 
 
 
308 aa  86.7  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000827586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1115  hypothetical protein  24.89 
 
 
316 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415846  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4146  hypothetical protein  24.4 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.185642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6526  hypothetical protein  26.58 
 
 
320 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435938  normal  0.151944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2010  hypothetical protein  24.55 
 
 
313 aa  55.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3459  hypothetical protein  20.64 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0353922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4333  hypothetical protein  23.43 
 
 
302 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2590  chromosome segregation ATPase  24.69 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>