16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4333 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4333  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  610  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5597  hypothetical protein  48.84 
 
 
311 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.872551  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4377  hypothetical protein  44.13 
 
 
317 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2010  hypothetical protein  47 
 
 
313 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1115  hypothetical protein  42.05 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415846  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3459  hypothetical protein  30.58 
 
 
305 aa  136  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0353922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2590  chromosome segregation ATPase  31.8 
 
 
309 aa  119  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6526  hypothetical protein  28.62 
 
 
320 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435938  normal  0.151944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4146  hypothetical protein  28.43 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.185642 
 
 
-
 
NC_002950  PG1387  hypothetical protein  26.04 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000827586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2187  hypothetical protein  28.47 
 
 
189 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.619306  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08331  hypothetical protein  26.87 
 
 
293 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4571  hypothetical protein  27.13 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01735  hypothetical protein  23.43 
 
 
294 aa  53.1  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.354262  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0072  hypothetical protein  22.37 
 
 
321 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.9 
 
 
957 aa  42.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>