16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4146 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4146  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  609  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.185642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4377  hypothetical protein  25.79 
 
 
317 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6526  hypothetical protein  27.06 
 
 
320 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435938  normal  0.151944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4333  hypothetical protein  28.43 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5597  hypothetical protein  26.16 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.872551  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4571  hypothetical protein  28.77 
 
 
293 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1115  hypothetical protein  24.08 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415846  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2010  hypothetical protein  29.73 
 
 
313 aa  72.4  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0072  hypothetical protein  26.62 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3459  hypothetical protein  26.37 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0353922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2590  chromosome segregation ATPase  26.01 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1186  hypothetical protein  23.79 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1387  hypothetical protein  24.16 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000827586 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01735  hypothetical protein  24.4 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.354262  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2187  hypothetical protein  29.45 
 
 
189 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.619306  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08331  hypothetical protein  24.22 
 
 
293 aa  42.7  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>