16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6526 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6526  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  655    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435938  normal  0.151944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5597  hypothetical protein  29.26 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.872551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3459  hypothetical protein  28.77 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0353922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4377  hypothetical protein  29.82 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2010  hypothetical protein  30.58 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4333  hypothetical protein  28.62 
 
 		 302 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4146  hypothetical protein  27.06 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185642 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4571  hypothetical protein  25.83 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2590  chromosome segregation ATPase  27.44 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1115  hypothetical protein  24.49 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415846  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0072  hypothetical protein  25.51 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1387  hypothetical protein  25.86 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000827586 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08331  hypothetical protein  23.37 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01735  hypothetical protein  26.58 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.354262  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1186  hypothetical protein  26.01 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2187  hypothetical protein  29.13 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.619306  normal  0.0970629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>