14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08331 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08331  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  585  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01735  hypothetical protein  34.13 
 
 
294 aa  186  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.354262  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0072  hypothetical protein  35.14 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4571  hypothetical protein  33.1 
 
 
293 aa  162  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1186  hypothetical protein  24.29 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4333  hypothetical protein  26.87 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6526  hypothetical protein  23.37 
 
 
320 aa  62.4  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435938  normal  0.151944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5597  hypothetical protein  25.79 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.872551  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4377  hypothetical protein  25.6 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1387  hypothetical protein  25.32 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000827586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3459  hypothetical protein  21.94 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0353922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1115  hypothetical protein  24.02 
 
 
316 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415846  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2590  chromosome segregation ATPase  23.9 
 
 
309 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4146  hypothetical protein  24.22 
 
 
302 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.185642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>