More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35970 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35970  Adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 488 aa  988    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3228  adenylosuccinate lyase  78.42 
 
 		 480 aa  777    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3429  Adenylosuccinate lyase  76.91 
 
 		 482 aa  726    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.216694 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2476  adenylosuccinate lyase  76.36 
 
 		 484 aa  760    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.408912  normal  0.116565 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01820  adenylosuccinate lyase  68.72 
 
 		 481 aa  658    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3826  adenylosuccinate lyase  67.22 
 
 		 480 aa  652    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3976  adenylosuccinate lyase  72.61 
 
 		 483 aa  691    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.976031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4033  adenylosuccinate lyase  67.65 
 
 		 480 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25530  adenylosuccinate lyase  67.58 
 
 		 471 aa  626  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.73948  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20390  adenylosuccinate lyase  65.98 
 
 		 475 aa  614  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4296  adenylosuccinate lyase  66.6 
 
 		 470 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173423  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0707  adenylosuccinate lyase  59.58 
 
 		 480 aa  562  1.0000000000000001e-159  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.444547 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1978  adenylosuccinate lyase  56.72 
 
 		 478 aa  560  1e-158  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.673816  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3858  adenylosuccinate lyase  49.78 
 
 		 460 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01129  adenylosuccinate lyase  48.51 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1251  adenylosuccinate lyase  48.51 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2540  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1294  adenylosuccinate lyase  48.51 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1137  adenylosuccinate lyase  48.91 
 
 		 465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1940  adenylosuccinate lyase  48.28 
 
 		 455 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1826  adenylosuccinate lyase  48.3 
 
 		 456 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2472  adenylosuccinate lyase  48.51 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01137  hypothetical protein  48.51 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1592  adenylosuccinate lyase  48.51 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2707  adenylosuccinate lyase  49.57 
 
 		 456 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0624698 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1309  adenylosuccinate lyase  48.51 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2516  adenylosuccinate lyase  48.3 
 
 		 456 aa  451  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00611502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1994  adenylosuccinate lyase  48.3 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.922086 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2152  adenylosuccinate lyase  49.35 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0629713  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2635  adenylosuccinate lyase  49.79 
 
 		 456 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1601  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 456 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1676  adenylosuccinate lyase  49.57 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.167323  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1745  adenylosuccinate lyase  49.79 
 
 		 456 aa  451  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1764  adenylosuccinate lyase  50.22 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1867  adenylosuccinate lyase  48.92 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01822  adenylosuccinate lyase  47.58 
 
 		 478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1879  adenylosuccinate lyase  48.28 
 
 		 455 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000162136 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2235  adenylosuccinate lyase  48.72 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0334521  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2593  adenylosuccinate lyase  48.94 
 
 		 456 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138176  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2446  adenylosuccinate lyase  50.65 
 
 		 454 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.673472  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1558  adenylosuccinate lyase  48.7 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1871  adenylosuccinate lyase  48.72 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0121528  hitchhiker  0.00000377009 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2473  adenylosuccinate lyase  48.72 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1065  adenylosuccinate lyase  50.54 
 
 		 458 aa  448  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.403225  normal  0.751482 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29392  predicted protein  48.61 
 
 		 505 aa  442  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.881924 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1644  adenylosuccinate lyase  47.23 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2065  adenylosuccinate lyase  47.02 
 
 		 455 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2576  adenylosuccinate lyase  53.03 
 
 		 462 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000542791 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003857  adenylosuccinate lyase  48.92 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.574073  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1952  adenylosuccinate lyase  47.87 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1311  adenylosuccinate lyase  47.87 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.634296  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2134  adenylosuccinate lyase  47.87 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0323604 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1333  adenylosuccinate lyase  47.87 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.887926  normal  0.184863 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02370  adenylosuccinate lyase  47.65 
 
 		 455 aa  442  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1593  adenylosuccinate lyase  48.27 
 
 		 455 aa  444  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2064  adenylosuccinate lyase  49.14 
 
 		 456 aa  441  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00558095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1349  adenylosuccinate lyase  47.87 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2480  adenylosuccinate lyase  48.3 
 
 		 456 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.866176  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1511  adenylosuccinate lyase  50.43 
 
 		 483 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.411987 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2020  adenylosuccinate lyase  47.45 
 
 		 456 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.581783  normal  0.312762 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3268  adenylosuccinate lyase  49.57 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1718  adenylosuccinate lyase  47.02 
 
 		 456 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1610  adenylosuccinate lyase  47.02 
 
 		 456 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2853  adenylosuccinate lyase  47.02 
 
 		 456 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3366  adenylosuccinate lyase  51.73 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000111293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2442  adenylosuccinate lyase  51.95 
 
 		 462 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1849  adenylosuccinate lyase  50.86 
 
 		 455 aa  438  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3288  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.650237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0358  adenylosuccinate lyase  51.95 
 
 		 462 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2627  adenylosuccinate lyase  52.16 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0157894  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2646  adenylosuccinate lyase  48.61 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.147554  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1794  adenylosuccinate lyase  51.08 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0813752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2956  adenylosuccinate lyase  50.32 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2195  adenylosuccinate lyase  47.4 
 
 		 456 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1216  adenylosuccinate lyase  52.16 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0644  adenylosuccinate lyase  47.84 
 
 		 456 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3402  adenylosuccinate lyase  52.16 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2720  adenylosuccinate lyase  50.96 
 
 		 457 aa  435  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2902  adenylosuccinate lyase  47.63 
 
 		 456 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0026  adenylosuccinate lyase  49.78 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2964  adenylosuccinate lyase  50.74 
 
 		 457 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.989167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1221  adenylosuccinate lyase  51.3 
 
 		 483 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0633  adenylosuccinate lyase  51.08 
 
 		 462 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1675  adenylosuccinate lyase  48.06 
 
 		 459 aa  435  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2381  adenylosuccinate lyase  46.77 
 
 		 455 aa  435  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1358  adenylosuccinate lyase  47.63 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2262  adenylosuccinate lyase  47.02 
 
 		 456 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1784  adenylosuccinate lyase  49.02 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.47541  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0518  adenylosuccinate lyase  51.07 
 
 		 456 aa  430  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.448433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2627  adenylosuccinate lyase  52.38 
 
 		 455 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108718  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2578  adenylosuccinate lyase  50.76 
 
 		 456 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.763537  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0593  adenylosuccinate lyase  51.3 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0183  adenylosuccinate lyase  51.08 
 
 		 462 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2554  adenylosuccinate lyase  50.32 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.660215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30110  adenylosuccinate lyase  50.98 
 
 		 456 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0666  adenylosuccinate lyase  51.08 
 
 		 462 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600757  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0961  adenylosuccinate lyase  48.92 
 
 		 457 aa  429  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118587 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2819  adenylosuccinate lyase  50.64 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3436  adenylosuccinate lyase  52.16 
 
 		 462 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.587084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2402  adenylosuccinate lyase  50.33 
 
 		 456 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129184  normal  0.0983593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>