24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2308 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2308  hypothetical protein  100 
 
 		 962 aa  1966    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  28.25 
 
 		 1408 aa  92  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  28.25 
 
 		 1410 aa  91.7  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  28.25 
 
 		 1410 aa  91.7  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  28.29 
 
 		 1422 aa  90.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01641  hypothetical protein  30.85 
 
 		 896 aa  77.4  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2711  hypothetical protein  24.93 
 
 		 965 aa  67.4  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05976  hypothetical protein  22.63 
 
 		 850 aa  64.7  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05832  peptidase  21.62 
 
 		 847 aa  62  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05990  hypothetical protein  21.52 
 
 		 857 aa  60.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  28.7 
 
 		 2377 aa  55.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0591  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1010 aa  55.5  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.15 
 
 		 850 aa  53.9  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0619  Ig domain protein group 1 domain protein  22.16 
 
 		 968 aa  54.3  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0615  Ig domain-containing protein  22.16 
 
 		 968 aa  54.3  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0498521  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0588  Ig domain-containing protein  22.16 
 
 		 968 aa  54.3  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  26.98 
 
 		 1597 aa  52.8  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  27.24 
 
 		 1367 aa  49.7  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.68 
 
 		 761 aa  48.9  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  27.3 
 
 		 3927 aa  48.5  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.97 
 
 		 994 aa  48.1  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  25.68 
 
 		 892 aa  48.1  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  24.79 
 
 		 1363 aa  46.6  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  24.56 
 
 		 2074 aa  45.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>