25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0897 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0897  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  277  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0111601  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0879  hypothetical protein  65.71 
 
 		 127 aa  157  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133146  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0982  hypothetical protein  53.91 
 
 		 139 aa  150  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0757327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1031  hypothetical protein  54.05 
 
 		 137 aa  141  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000817032  normal  0.63467 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3593  hypothetical protein  54.7 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3183  hypothetical protein  52.59 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0657806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1105  hypothetical protein  52.21 
 
 		 136 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0528492  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1003  hypothetical protein  52.21 
 
 		 136 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000302233  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3286  hypothetical protein  52.21 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000912714  normal  0.19871 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1011  hypothetical protein  52 
 
 		 137 aa  135  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00108871  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1072  hypothetical protein  51.33 
 
 		 136 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263359  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3005  hypothetical protein  51.28 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109936  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3086  hypothetical protein  51.28 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000744436  normal  0.456635 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2799  hypothetical protein  40.71 
 
 		 133 aa  96.7  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0708465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0549  peptidoglycan-binding LysM  24.26 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00118336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2698  hypothetical protein  26.36 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.376582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3570  hypothetical protein  25.6 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.217533  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0748  hypothetical protein  25.6 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.314999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3691  hypothetical protein  25.6 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  normal  0.0136515 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3502  hypothetical protein  25.6 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0153  hypothetical protein  31.71 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.489061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0843  hypothetical protein  26.77 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00211691  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0682  hypothetical protein  23 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0289  hypothetical protein  21.71 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3063  hypothetical protein  22.31 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>