19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0549 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0549  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 140 aa  288  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00118336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1011  hypothetical protein  27.91 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00108871  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0982  hypothetical protein  30.83 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0757327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1105  hypothetical protein  29.27 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0528492  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1072  hypothetical protein  29.27 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263359  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1003  hypothetical protein  29.92 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000302233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3593  hypothetical protein  26.61 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3183  hypothetical protein  27.42 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0657806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3005  hypothetical protein  25 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109936  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3086  hypothetical protein  25 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000744436  normal  0.456635 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3286  hypothetical protein  27.88 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000912714  normal  0.19871 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0289  hypothetical protein  32.71 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0897  hypothetical protein  24.26 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0111601  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1031  hypothetical protein  26.67 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000817032  normal  0.63467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0879  hypothetical protein  27.88 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0682  hypothetical protein  24.24 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1424  hypothetical protein  27.1 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259146  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0633  hypothetical protein  23.81 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.482493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2799  hypothetical protein  28 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0708465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>