20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0289 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0289  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  281  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3063  hypothetical protein  38.33 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3979  hypothetical protein  38.53 
 
 		 129 aa  97.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0843  hypothetical protein  33.83 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00211691  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3502  hypothetical protein  31.82 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3691  hypothetical protein  31.82 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  normal  0.0136515 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3570  hypothetical protein  31.82 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.217533  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0748  hypothetical protein  31.82 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.314999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0556  hypothetical protein  34.86 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1424  hypothetical protein  34.31 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0682  hypothetical protein  27.46 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0549  peptidoglycan-binding LysM  32.71 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00118336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1011  hypothetical protein  26.87 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00108871  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3593  hypothetical protein  26.92 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0982  hypothetical protein  24.6 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0757327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0897  hypothetical protein  21.71 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0111601  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0153  hypothetical protein  28.16 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.489061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2698  hypothetical protein  23.85 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.376582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0805  hypothetical protein  25.71 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00341029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0879  hypothetical protein  24.03 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>