16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2698 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2698  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.376582  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3183  hypothetical protein  29.84 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0657806  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3005  hypothetical protein  29.84 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109936  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3086  hypothetical protein  29.84 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000744436  normal  0.456635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0879  hypothetical protein  32.38 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133146  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1011  hypothetical protein  25.81 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00108871  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1003  hypothetical protein  29.03 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000302233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3593  hypothetical protein  27.42 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0897  hypothetical protein  26.36 
 
 
133 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0111601  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1105  hypothetical protein  28.23 
 
 
136 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0528492  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3286  hypothetical protein  28.57 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000912714  normal  0.19871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1424  hypothetical protein  29.47 
 
 
146 aa  50.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1072  hypothetical protein  27.42 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263359  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0153  hypothetical protein  26.36 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.489061  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0682  hypothetical protein  20.86 
 
 
141 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0289  hypothetical protein  23.85 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>