19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3086 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3005  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  266  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109936  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3086  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  266  8e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000744436  normal  0.456635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3183  hypothetical protein  92.31 
 
 		 130 aa  248  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0657806  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3593  hypothetical protein  86.61 
 
 		 127 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1003  hypothetical protein  67.69 
 
 		 136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000302233  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1105  hypothetical protein  66.92 
 
 		 136 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0528492  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1072  hypothetical protein  66.92 
 
 		 136 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263359  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1011  hypothetical protein  64.62 
 
 		 137 aa  183  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00108871  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3286  hypothetical protein  68.07 
 
 		 118 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000912714  normal  0.19871 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0879  hypothetical protein  55.12 
 
 		 127 aa  140  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0897  hypothetical protein  51.28 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0111601  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1031  hypothetical protein  47.54 
 
 		 137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000817032  normal  0.63467 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0982  hypothetical protein  48.03 
 
 		 139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0757327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2799  hypothetical protein  40.54 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0708465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2698  hypothetical protein  29.84 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.376582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0549  peptidoglycan-binding LysM  25 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00118336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0153  hypothetical protein  33.65 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.489061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1424  hypothetical protein  27.69 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0682  hypothetical protein  23.66 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>