22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0153 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0153  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  253  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.489061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2799  hypothetical protein  38.46 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0708465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1424  hypothetical protein  30.83 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3005  hypothetical protein  33.65 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109936  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3086  hypothetical protein  33.65 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000744436  normal  0.456635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3183  hypothetical protein  30 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0657806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1031  hypothetical protein  31.52 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000817032  normal  0.63467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2698  hypothetical protein  26.36 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.376582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0982  hypothetical protein  31.07 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0757327  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3593  hypothetical protein  28.85 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0897  hypothetical protein  31.71 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0111601  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0879  hypothetical protein  29.81 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133146  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1011  hypothetical protein  25.96 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00108871  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0289  hypothetical protein  28.16 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1072  hypothetical protein  27.36 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263359  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1105  hypothetical protein  27.36 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0528492  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3306  hypothetical protein  25 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0153759  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0682  hypothetical protein  29.13 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1003  hypothetical protein  26.92 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000302233  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3286  hypothetical protein  26.92 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000912714  normal  0.19871 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0820  hypothetical protein  25.96 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0772039  hitchhiker  0.0000156242 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3203  hypothetical protein  25.96 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.647543  normal  0.274146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>