24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0682 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0682  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  290  7e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1424  hypothetical protein  38.58 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259146  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3063  hypothetical protein  30 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0843  hypothetical protein  29.37 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00211691  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3979  hypothetical protein  32.73 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0556  hypothetical protein  28.12 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3502  hypothetical protein  30.84 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3691  hypothetical protein  30.84 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  normal  0.0136515 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3570  hypothetical protein  30.84 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.217533  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0748  hypothetical protein  30.84 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.314999  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0289  hypothetical protein  27.46 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0820  hypothetical protein  27.35 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0772039  hitchhiker  0.0000156242 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3203  hypothetical protein  27.27 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.647543  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0549  peptidoglycan-binding LysM  24.24 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00118336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3306  hypothetical protein  24.73 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0153759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0879  hypothetical protein  22.05 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0897  hypothetical protein  23 
 
 		 133 aa  44.3  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0111601  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2698  hypothetical protein  20.86 
 
 		 131 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.376582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1011  hypothetical protein  20.77 
 
 		 137 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00108871  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3183  hypothetical protein  21.82 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0657806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0153  hypothetical protein  29.13 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.489061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3086  hypothetical protein  23.66 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000744436  normal  0.456635 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3005  hypothetical protein  23.66 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109936  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0633  hypothetical protein  22 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.482493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>