20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1011 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1011  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  280  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00108871  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1003  hypothetical protein  70.07 
 
 
136 aa  207  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000302233  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1105  hypothetical protein  70.07 
 
 
136 aa  206  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0528492  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1072  hypothetical protein  69.34 
 
 
136 aa  204  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263359  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3183  hypothetical protein  67.69 
 
 
130 aa  189  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0657806  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3286  hypothetical protein  70.59 
 
 
118 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000912714  normal  0.19871 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3005  hypothetical protein  64.62 
 
 
130 aa  183  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109936  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3086  hypothetical protein  64.62 
 
 
130 aa  183  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000744436  normal  0.456635 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3593  hypothetical protein  65.35 
 
 
127 aa  178  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0897  hypothetical protein  52 
 
 
133 aa  135  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0111601  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0982  hypothetical protein  49.21 
 
 
139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0757327  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0879  hypothetical protein  49.61 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133146  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1031  hypothetical protein  46.72 
 
 
137 aa  124  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000817032  normal  0.63467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2799  hypothetical protein  40.35 
 
 
133 aa  98.6  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0708465  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0549  peptidoglycan-binding LysM  27.91 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00118336  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2698  hypothetical protein  25.81 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.376582  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0289  hypothetical protein  26.87 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1424  hypothetical protein  23.7 
 
 
146 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259146  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0153  hypothetical protein  25.96 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.489061  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0682  hypothetical protein  20.77 
 
 
141 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>