17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2799 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2799  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  268  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0708465  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1011  hypothetical protein  40.16 
 
 
137 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00108871  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3183  hypothetical protein  40.16 
 
 
130 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0657806  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3593  hypothetical protein  39.34 
 
 
127 aa  100  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0897  hypothetical protein  39.52 
 
 
133 aa  100  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0111601  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1003  hypothetical protein  38.84 
 
 
136 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000302233  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0982  hypothetical protein  37.1 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0757327  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1105  hypothetical protein  38.02 
 
 
136 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0528492  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3086  hypothetical protein  37.69 
 
 
130 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000744436  normal  0.456635 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3005  hypothetical protein  37.69 
 
 
130 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109936  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3286  hypothetical protein  38.98 
 
 
118 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000912714  normal  0.19871 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1072  hypothetical protein  37.19 
 
 
136 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0879  hypothetical protein  37.01 
 
 
127 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133146  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1031  hypothetical protein  35.96 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000817032  normal  0.63467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0153  hypothetical protein  38.46 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.489061  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0549  peptidoglycan-binding LysM  26.56 
 
 
140 aa  47  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00118336  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1424  hypothetical protein  23.7 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>