18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1105 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1105  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0528492  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1072  hypothetical protein  99.26 
 
 
136 aa  279  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263359  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1003  hypothetical protein  98.53 
 
 
136 aa  278  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000302233  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3286  hypothetical protein  98.31 
 
 
118 aa  244  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000912714  normal  0.19871 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1011  hypothetical protein  70.07 
 
 
137 aa  206  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00108871  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3183  hypothetical protein  67.69 
 
 
130 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0657806  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3086  hypothetical protein  66.92 
 
 
130 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000744436  normal  0.456635 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3005  hypothetical protein  66.92 
 
 
130 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109936  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3593  hypothetical protein  66.93 
 
 
127 aa  190  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0879  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0897  hypothetical protein  52.21 
 
 
133 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0111601  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0982  hypothetical protein  46.04 
 
 
139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0757327  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1031  hypothetical protein  45.9 
 
 
137 aa  121  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000817032  normal  0.63467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2799  hypothetical protein  38.6 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0708465  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0549  peptidoglycan-binding LysM  29.27 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00118336  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2698  hypothetical protein  28.23 
 
 
131 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.376582  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0153  hypothetical protein  27.36 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.489061  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1424  hypothetical protein  23.13 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>