19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3593 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3593  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3005  hypothetical protein  86.61 
 
 		 130 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109936  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3086  hypothetical protein  86.61 
 
 		 130 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000744436  normal  0.456635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3183  hypothetical protein  84.25 
 
 		 130 aa  224  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0657806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1003  hypothetical protein  67.72 
 
 		 136 aa  191  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000302233  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1105  hypothetical protein  66.93 
 
 		 136 aa  190  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0528492  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1072  hypothetical protein  66.93 
 
 		 136 aa  189  9e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263359  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3286  hypothetical protein  68.07 
 
 		 118 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000912714  normal  0.19871 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1011  hypothetical protein  65.35 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00108871  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0879  hypothetical protein  57.01 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0897  hypothetical protein  54.7 
 
 		 133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0111601  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0982  hypothetical protein  49.61 
 
 		 139 aa  133  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0757327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1031  hypothetical protein  48.36 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000817032  normal  0.63467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2799  hypothetical protein  40.54 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0708465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0549  peptidoglycan-binding LysM  26.61 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00118336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2698  hypothetical protein  27.42 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.376582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0153  hypothetical protein  28.85 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.489061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0289  hypothetical protein  26.92 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1424  hypothetical protein  23.97 
 
 		 146 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>