18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0982 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0982  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  288  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0757327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1031  hypothetical protein  63.93 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000817032  normal  0.63467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0879  hypothetical protein  58.78 
 
 		 127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0897  hypothetical protein  53.91 
 
 		 133 aa  150  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0111601  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3183  hypothetical protein  50.39 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0657806  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3593  hypothetical protein  49.61 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1003  hypothetical protein  46.76 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000302233  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1105  hypothetical protein  46.04 
 
 		 136 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0528492  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1011  hypothetical protein  49.21 
 
 		 137 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00108871  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1072  hypothetical protein  46.04 
 
 		 136 aa  129  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00263359  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3286  hypothetical protein  51.79 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000912714  normal  0.19871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3086  hypothetical protein  48.03 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000744436  normal  0.456635 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3005  hypothetical protein  48.03 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109936  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2799  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0708465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0549  peptidoglycan-binding LysM  30.83 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00118336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0153  hypothetical protein  31.07 
 
 		 126 aa  47.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.489061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0289  hypothetical protein  24.6 
 
 		 136 aa  43.9  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0843  hypothetical protein  28.23 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00211691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>