144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2274 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2274  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.810246  normal  0.954547 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0953  hypothetical protein  43.26 
 
 
209 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.928934  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3186  protein of unknown function DUF47  41.31 
 
 
209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.640188 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1961  hypothetical protein  30 
 
 
209 aa  108  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  30.73 
 
 
211 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  27.96 
 
 
205 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  30.73 
 
 
211 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  29.25 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  28.84 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  26.54 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  27.01 
 
 
205 aa  95.5  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  27.01 
 
 
205 aa  94.7  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  27.83 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  28.85 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  27.36 
 
 
219 aa  92.8  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  27.65 
 
 
210 aa  92  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  25.12 
 
 
205 aa  91.7  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  27.65 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  27.96 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  27.96 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  27.36 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  26.51 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  26.54 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  27.01 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  24.76 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  26.36 
 
 
206 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  27.78 
 
 
209 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  23.94 
 
 
282 aa  85.5  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  24.19 
 
 
208 aa  85.1  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  24.29 
 
 
205 aa  84.7  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  26.89 
 
 
208 aa  84.7  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  26.7 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  24.17 
 
 
209 aa  82  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  24.17 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  25.12 
 
 
205 aa  82  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  26.27 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  26.27 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1336  protein of unknown function DUF47  23.22 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  29.09 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  28.1 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  25.12 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  27.11 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  25.12 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  22.12 
 
 
208 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  24.64 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  24.64 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  24.64 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  25.12 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  26.61 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  25.81 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  23.96 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2716  protein of unknown function DUF47  27.36 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  25.81 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  26.27 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  24.64 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  24.34 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  23.5 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0643  phosphate transport regulator  24.27 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.233591  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  23.7 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  24.52 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  24.65 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  24.65 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  24.65 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  24.64 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  24.65 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  24.65 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  24.65 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  24.65 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  24.65 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  24.64 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  25.12 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  25 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  27.6 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0240  hypothetical protein  20.37 
 
 
209 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  24.17 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  23.7 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000193859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  23.7 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000180581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  23.7 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  23.7 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  23.7 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  24.17 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  23.7 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000312847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  24.17 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  23.7 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000502331  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2947  hypothetical protein  24.19 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.847202  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  23.7 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000750489  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2877  protein of unknown function DUF47  27.62 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0461875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  23.7 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  22.12 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  25.68 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0920  hypothetical protein  25.71 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5971  hypothetical protein  25.46 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  24.77 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  24.07 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  22.64 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  21.23 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  23.58 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  23.22 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1024  phosphate transport regulator-like  24.41 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  24.64 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000863551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>