23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1323 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1323  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  473  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2599  hypothetical protein  62.15 
 
 		 219 aa  296  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2614  hypothetical protein  59.82 
 
 		 231 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.234616  hitchhiker  0.0000133675 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2681  hypothetical protein  57.96 
 
 		 231 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.140782  unclonable  0.0000421056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2788  hypothetical protein  60.09 
 
 		 224 aa  280  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.0156454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1658  hypothetical protein  59.46 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1373  hypothetical protein  58.9 
 
 		 224 aa  275  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.48509  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1443  hypothetical protein  56.56 
 
 		 224 aa  264  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000382578  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1477  hypothetical protein  59.63 
 
 		 227 aa  262  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1508  hypothetical protein  59.63 
 
 		 227 aa  262  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1472  hypothetical protein  59.63 
 
 		 227 aa  262  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00599836  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2875  hypothetical protein  59.63 
 
 		 227 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121619  hitchhiker  0.0000113263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2229  hypothetical protein  59.71 
 
 		 230 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2935  hypothetical protein  57.56 
 
 		 225 aa  259  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00068648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1710  hypothetical protein  57.49 
 
 		 224 aa  257  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0344623  normal  0.96681 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1430  hypothetical protein  47.95 
 
 		 222 aa  224  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000396179  normal  0.150397 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00489  hypothetical protein  35.62 
 
 		 238 aa  132  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0506  hypothetical protein  32.3 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1245  hypothetical protein  36.41 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0828  hypothetical protein  34.3 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  0.0747999 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003130  hypothetical protein  31.11 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000034584  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0889  hypothetical protein  30.69 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02707  hypothetical protein  30.06 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>