23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2681 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2681  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.140782  unclonable  0.0000421056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2614  hypothetical protein  98.27 
 
 
231 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.234616  hitchhiker  0.0000133675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2788  hypothetical protein  95.98 
 
 
224 aa  441  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.0156454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1658  hypothetical protein  92.51 
 
 
243 aa  431  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1373  hypothetical protein  86.16 
 
 
224 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.48509  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2875  hypothetical protein  81.53 
 
 
227 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121619  hitchhiker  0.0000113263 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1477  hypothetical protein  81.98 
 
 
227 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1508  hypothetical protein  81.98 
 
 
227 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1472  hypothetical protein  81.98 
 
 
227 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00599836  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1323  hypothetical protein  57.96 
 
 
231 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1443  hypothetical protein  59.91 
 
 
224 aa  264  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000382578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2599  hypothetical protein  57.14 
 
 
219 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2935  hypothetical protein  54.98 
 
 
225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00068648  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2229  hypothetical protein  54.55 
 
 
230 aa  249  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1710  hypothetical protein  53.88 
 
 
224 aa  248  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0344623  normal  0.96681 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1430  hypothetical protein  46.51 
 
 
222 aa  219  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000396179  normal  0.150397 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00489  hypothetical protein  35.37 
 
 
238 aa  137  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0506  hypothetical protein  34.84 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1245  hypothetical protein  36.56 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0828  hypothetical protein  34.58 
 
 
227 aa  98.2  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  0.0747999 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003130  hypothetical protein  32.12 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000034584  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0889  hypothetical protein  33.1 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02707  hypothetical protein  28.5 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>