23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1245 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1245  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0828  hypothetical protein  38.07 
 
 
227 aa  148  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  0.0747999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1658  hypothetical protein  38.43 
 
 
243 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2614  hypothetical protein  37 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.234616  hitchhiker  0.0000133675 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2681  hypothetical protein  36.56 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.140782  unclonable  0.0000421056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2788  hypothetical protein  35.96 
 
 
224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.0156454 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2599  hypothetical protein  36.11 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2875  hypothetical protein  39.44 
 
 
227 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121619  hitchhiker  0.0000113263 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1477  hypothetical protein  39.44 
 
 
227 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1472  hypothetical protein  39.44 
 
 
227 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00599836  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1508  hypothetical protein  39.44 
 
 
227 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1373  hypothetical protein  36.49 
 
 
224 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.48509  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2935  hypothetical protein  32.73 
 
 
225 aa  125  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00068648  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1710  hypothetical protein  36.36 
 
 
224 aa  122  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0344623  normal  0.96681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1323  hypothetical protein  36.41 
 
 
231 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2229  hypothetical protein  36.41 
 
 
230 aa  121  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1443  hypothetical protein  40.34 
 
 
224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000382578  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1430  hypothetical protein  32.87 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000396179  normal  0.150397 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00489  hypothetical protein  31.84 
 
 
238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0506  hypothetical protein  30.37 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02707  hypothetical protein  27.31 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003130  hypothetical protein  27.72 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000034584  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0889  hypothetical protein  27.78 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>